Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNIP3Q96KP6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNIP3Q96KP6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms