Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms