Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHDQ96IW2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHDQ96IW2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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