Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAX2Q96IS3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAX2Q96IS3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms