Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNF8Q96H20 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNF8Q96H20 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms