Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BORCS6Q96GS4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BORCS6Q96GS4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BORCS6Q96GS4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BORCS6Q96GS4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BORCS6Q96GS4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BORCS6Q96GS4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BORCS6Q96GS4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BORCS6Q96GS4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BORCS6Q96GS4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BORCS6Q96GS4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BORCS6Q96GS4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BORCS6Q96GS4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BORCS6Q96GS4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BORCS6Q96GS4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms