Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT43Q96FT9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT43Q96FT9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms