Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM11Q96F44 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms