Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms