Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms