Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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LRRC39Q96DD0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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LRRC39Q96DD0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRC39Q96DD0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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