Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4CQ96CF2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP4CQ96CF2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms