Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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