Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD2Q96BF3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD2Q96BF3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms