Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC59Q96AG4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC59Q96AG4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC59Q96AG4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC59Q96AG4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms