Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF3C6Q969F1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF3C6Q969F1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms