Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA6Q92908 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA6Q92908 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms