Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERVK_113Q902F9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERVK_113Q902F9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms