Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms