Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC12Q8WVT3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms