Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3RF2Q8TEC5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3RF2Q8TEC5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms