Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI51

CTCFL, Transcriptional repressor CTCFL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFLQ8NI51 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTCFLQ8NI51 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTCFLQ8NI51 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
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