Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU7

TET1, Methylcytosine dioxygenase TET1, humanhuman

Predictions only

Length 2,136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TET1Q8NFU7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TET1Q8NFU7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TET1Q8NFU7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TET1Q8NFU7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TET1Q8NFU7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TET1Q8NFU7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms