Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A3Q8NEV1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSNK2A3Q8NEV1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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