Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDPRQ8NCN5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDPRQ8NCN5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms