Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPC24Q8NBT2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPC24Q8NBT2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms