Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP11CQ8NB49 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11CQ8NB49 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms