Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC33Q8N5R6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms