Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
GPC2Q8N158 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC2Q8N158 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms