Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMYD4Q8IYR2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD4Q8IYR2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD4Q8IYR2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms