Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT20Q8IY31 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms