Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL3Q8IVW4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL3Q8IVW4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL3Q8IVW4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms