Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX29P2Q8IUI4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms