Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFNL1Q8IU54 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNL1Q8IU54 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms