Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPBP1Q86WP2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPBP1Q86WP2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms