Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCA5Q86VQ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms