Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC3Q7Z5M5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC3Q7Z5M5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms