Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYFIP1Q7L576 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYFIP1Q7L576 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms