Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC80Q76M96 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms