Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2AFVQ71UI9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFVQ71UI9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms