Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC149Q6ZUS6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC149Q6ZUS6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms