Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCD1Q6ZMY3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCD1Q6ZMY3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms