Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNI2Q6ZMN8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNI2Q6ZMN8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms