Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZRN4Q6ZMN7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms