Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARA5Q6ZMJ2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARA5Q6ZMJ2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms