Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CASP12Q6UXS9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP12Q6UXS9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms