Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRIG3Q6UXM1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms