Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBR1LQ6UX01 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBR1LQ6UX01 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms