Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms