Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC25A47Q6Q0C1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC25A47Q6Q0C1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms